Mühendislik ve Doğa Bilimleri Fakültesi · Moleküler Biyoloji ve Genetik (%30 İngilizce) · Lisans
Dersin Amacı
Bu dersin amacı öğrencilerin genom, genom dizilimi, genom ifadesi, yapısal ve fonksiyonel genom kavramlarını, proteom çalışmalarını, proteinlerin fonkiyon ve analizlerinin nasıl yapılacağını öğrenmeleri amaçlanmaktadır.
Ders İçeriği
Genom tanımı, genom dizileme, genom anatasyonu , genomun yapısal ve işlevsel analizleri. Proteomik kapsamı; Protein ayrım ve tanımlama yöntemleri, Protein miktar tayini yöntemleri, Protein dizisinin analizi; Protein yapı ve fonksiyonu.
Zorunlu Kaynaklar
T.A. Brown,Genomes 4, Taylor &Francis,Garland Science, (2023)
Twyman, R., Cfe, P.D., & George A., Garland Principles of Proteomics (2nd ed.).Science. (2013).
Açıklamalar
- Bir vize, bir final ve 2 adet kısa sınav uygulanacaktır.
- Devamsızlık sınav yönetmeliği dekanlığın belirlediği kurallar çerçevesinde uygulanacaktır.
- Final konuları tüm konuları kapsayıcı olmakla beraber ağırlıklı olarak vize sonrası konulara yönelik olacaktır.
- Tüm sınavlar klasik uygulanacak ve yorum soruları da bulunacaktır.
Kurallar
Devam: Yönetmeliğe göre bir öğrenci toplam ders saatinin % 30’na (toplam 18 saat) devam etmemesi halinde dersten devamsızlık alır (DZ) ve başarısız olur. Devam imza ile kayıt altına alınacaktır
Geç Gelme: Sınıfa sadece gelmeniz değil vakitlice saatinde ders katılmanız beklenmektedir. Unutmayın ki 3 derse geç gelme 1 tam devamsızlık olarak sayılacaktır. Derse geç gelme şöyle tanımlanmaktır: Ders hocasının sınıf yoklamasını alması ve dersin ilk 10 dakikasından sonra derse katılmak
Yardım Almak: Ders esnasında ya da görüşme saatlerinde dersle ilgili sorularınızı sorup konuyu vaktinde öğrenmeniz eğitiminiz için önemlidir. Öğrencilerimizin, gerektiği hallerde, yardım almalarını tavsiye ediyoruz.
Akademik dürüstlük: Dersin notuna konu olacak çalışmalarda tamamen kendi gayret ve eseriniz olması beklenmektedir. İntihal, kopyalama gibi gayri ahlaki durumlarda İZÜ’nun ilgili yönetmeliği gereği disiplin soruşturması açılıp gerekli cezai müeyyidelere tabii olursunuz. Hasta olmanız durumunda raporunuzu beyan etmeniz gerekmektedir.
Bu izlencede belirtilen değerlendirmeler sabit olup, not yükseltme amaçlı herhangi bir ekstra telafi ölçme yapılmayacaktır.
Dersin Öğrenme Çıktıları
- Öğrenci genom ve proteom hakkında temel bilgileri edinir.
- Öğrenci genom dizileme ile ilgili mekanizmaları tartışır
- Öğrenci genomun yapısal ve işlevsel analizleri konusunda temel bilgiler edinir.
- Öğrenci protein ayırım, tanımlama ve miktar tayini hakkında bilgi edinir
- Öğrenci Protein dizi analizi, protein yapı ve fonksiyonu konuları tartışır.
Temel Alan Dağılımı
Öğretim Yöntem ve Teknikleri
Ölçme ve Değerlendirme
AKTS / İş Yükü
| Etkinlik | Sayı | Süre (saat) | Toplam İş Yükü |
|---|---|---|---|
| Ders Süresi (Sınav Haftası Dahil) | 16 | 3 | 48 |
| Sınıf Dışı Ders Çalışma Süresi | 16 | 3 | 48 |
| Ara Sınav | 1 | 2 | 2 |
| Kısa Sınav | 0 | 0 | 0 |
| Ödev | 2 | 13 | 26 |
| Uygulama | 0 | 0 | 0 |
| Final | 1 | 2 | 2 |
Ders Akışı
| Hafta | Konu | Ön Hazırlık |
|---|---|---|
| 1 | Genomiğe giriş | Ders kitabı |
| 2 | Gen ve Genome yapısı | Ders kitabı |
| 3 | Genome haritalama | Ders kitabı |
| 4 | Genom dizileme teknolojileri | Ders kitabı |
| 5 | Genom anotasyonu | Ders kitabı |
| 6 | Fonksiyonel ve karşılaştırmalı genomik | Ders kitabı |
| 7 | Transkriptomik | Ders kitabı |
| 8 | Ara sınav | Ara sınav |
| 9 | Proteomikse giriş | Ders kitabı |
| 10 | Protein ayrım ve karakterizasyon yöntemleri | Ders kitabı |
| 11 | Protein miktar tayini yöntemleri | Ders kitabı |
| 12 | Protein yapı ve dizi analizi yöntemleri | Ders kitabı |
| 13 | Protein- protein / protein- DNA etkileşim yöntemleri | Ders kitabı |
| 14 | Omiks uygulamaları 1 | Ders kitabı |
| 15 | Omiks Uygulamaları 2 | Ders kitabı |
| 16 | Final Sınavı | Final Sınavı |